Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXM1Q08050 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXM1Q08050 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms