Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LRP1Q07954 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms