Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51Q06609 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms