Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSME1Q06323 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSME1Q06323 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms