Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
XPCQ01831 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
XPCQ01831 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
XPCQ01831 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
XPCQ01831 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
XPCQ01831 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
XPCQ01831 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
XPCQ01831 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
XPCQ01831 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
XPCQ01831 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
XPCQ01831 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
XPCQ01831 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
XPCQ01831 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
XPCQ01831 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
XPCQ01831 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
XPCQ01831 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
XPCQ01831 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
XPCQ01831 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
XPCQ01831 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
XPCQ01831 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
XPCQ01831 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
XPCQ01831 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
XPCQ01831 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
XPCQ01831 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
XPCQ01831 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
XPCQ01831 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
XPCQ01831 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
XPCQ01831 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
XPCQ01831 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
XPCQ01831 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
XPCQ01831 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
XPCQ01831 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
XPCQ01831 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
XPCQ01831 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
XPCQ01831 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
XPCQ01831 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
XPCQ01831 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
XPCQ01831 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
XPCQ01831 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
XPCQ01831 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
XPCQ01831 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
XPCQ01831 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
XPCQ01831 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
XPCQ01831 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
XPCQ01831 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
XPCQ01831 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
XPCQ01831 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
XPCQ01831 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
XPCQ01831 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
XPCQ01831 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
XPCQ01831 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
XPCQ01831 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
XPCQ01831 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
XPCQ01831 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
XPCQ01831 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
XPCQ01831 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
XPCQ01831 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
XPCQ01831 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
XPCQ01831 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
XPCQ01831 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
XPCQ01831 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
XPCQ01831 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
XPCQ01831 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
XPCQ01831 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
XPCQ01831 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
XPCQ01831 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
XPCQ01831 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
XPCQ01831 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
XPCQ01831 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
XPCQ01831 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
XPCQ01831 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
XPCQ01831 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
XPCQ01831 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
XPCQ01831 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
XPCQ01831 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
XPCQ01831 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
XPCQ01831 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
XPCQ01831 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
XPCQ01831 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
XPCQ01831 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
XPCQ01831 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
XPCQ01831 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
XPCQ01831 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
XPCQ01831 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
XPCQ01831 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
XPCQ01831 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
XPCQ01831 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
XPCQ01831 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
XPCQ01831 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms