Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN7AQ01118 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN7AQ01118 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN7AQ01118 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms