Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK17Q00537 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms