Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC5Q00444 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms