Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX4P78413 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX4P78413 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX4P78413 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX4P78413 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX4P78413 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX4P78413 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX4P78413 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX4P78413 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX4P78413 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX4P78413 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX4P78413 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX4P78413 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX4P78413 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX4P78413 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX4P78413 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX4P78413 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX4P78413 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX4P78413 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX4P78413 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX4P78413 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX4P78413 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX4P78413 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX4P78413 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX4P78413 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX4P78413 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX4P78413 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX4P78413 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX4P78413 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX4P78413 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX4P78413 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX4P78413 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX4P78413 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRX4P78413 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX4P78413 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX4P78413 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX4P78413 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX4P78413 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX4P78413 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX4P78413 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX4P78413 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX4P78413 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRX4P78413 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRX4P78413 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX4P78413 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX4P78413 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRX4P78413 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX4P78413 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX4P78413 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX4P78413 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX4P78413 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX4P78413 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX4P78413 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX4P78413 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX4P78413 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX4P78413 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX4P78413 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms