Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UBE2L3P68036 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2L3P68036 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms