Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL38P63173 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL38P63173 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL38P63173 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL38P63173 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL38P63173 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL38P63173 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL38P63173 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL38P63173 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL38P63173 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL38P63173 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL38P63173 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL38P63173 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL38P63173 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL38P63173 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL38P63173 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL38P63173 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL38P63173 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL38P63173 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms