Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms