Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms