Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2FP61218 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms