Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP25P60880 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP25P60880 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms