Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP1S2P56377 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms