Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXCT1P55809 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms