Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52P55327 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52P55327 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52P55327 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52P55327 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52P55327 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52P55327 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52P55327 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52P55327 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52P55327 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52P55327 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52P55327 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52P55327 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52P55327 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52P55327 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52P55327 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52P55327 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPD52P55327 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPD52P55327 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52P55327 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52P55327 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52P55327 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52P55327 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52P55327 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52P55327 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPD52P55327 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52P55327 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52P55327 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52P55327 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52P55327 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52P55327 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPD52P55327 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPD52P55327 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52P55327 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52P55327 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52P55327 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52P55327 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52P55327 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52P55327 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPD52P55327 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52P55327 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52P55327 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52P55327 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52P55327 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52P55327 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPD52P55327 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPD52P55327 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPD52P55327 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms