Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AQP4P55087 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AQP4P55087 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AQP4P55087 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AQP4P55087 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AQP4P55087 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AQP4P55087 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AQP4P55087 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AQP4P55087 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AQP4P55087 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AQP4P55087 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AQP4P55087 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AQP4P55087 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AQP4P55087 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AQP4P55087 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AQP4P55087 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AQP4P55087 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AQP4P55087 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AQP4P55087 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AQP4P55087 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AQP4P55087 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AQP4P55087 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AQP4P55087 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AQP4P55087 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AQP4P55087 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AQP4P55087 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AQP4P55087 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AQP4P55087 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AQP4P55087 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AQP4P55087 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AQP4P55087 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AQP4P55087 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AQP4P55087 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms