Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP12AP54707 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP12AP54707 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP12AP54707 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms