Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARSP54136 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARSP54136 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARSP54136 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARSP54136 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARSP54136 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARSP54136 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARSP54136 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARSP54136 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARSP54136 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RARSP54136 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RARSP54136 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RARSP54136 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RARSP54136 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RARSP54136 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RARSP54136 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RARSP54136 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RARSP54136 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RARSP54136 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RARSP54136 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RARSP54136 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RARSP54136 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARSP54136 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARSP54136 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARSP54136 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARSP54136 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARSP54136 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARSP54136 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARSP54136 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARSP54136 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARSP54136 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARSP54136 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARSP54136 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARSP54136 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARSP54136 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARSP54136 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARSP54136 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARSP54136 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARSP54136 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RARSP54136 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RARSP54136 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RARSP54136 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RARSP54136 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RARSP54136 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RARSP54136 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RARSP54136 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARSP54136 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RARSP54136 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RARSP54136 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RARSP54136 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RARSP54136 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RARSP54136 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARSP54136 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARSP54136 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RARSP54136 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARSP54136 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RARSP54136 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms