Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF2A1P52655 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1P52655 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms