Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE6CP51160 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE6CP51160 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms