Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCAMP50895 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCAMP50895 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCAMP50895 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAMP50895 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAMP50895 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAMP50895 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAMP50895 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAMP50895 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAMP50895 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAMP50895 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAMP50895 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAMP50895 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAMP50895 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAMP50895 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAMP50895 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAMP50895 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAMP50895 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAMP50895 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAMP50895 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAMP50895 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAMP50895 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAMP50895 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAMP50895 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAMP50895 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAMP50895 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAMP50895 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAMP50895 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAMP50895 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAMP50895 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAMP50895 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAMP50895 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAMP50895 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAMP50895 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAMP50895 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAMP50895 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAMP50895 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAMP50895 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAMP50895 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCAMP50895 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCAMP50895 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCAMP50895 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCAMP50895 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAMP50895 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BCAMP50895 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAMP50895 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAMP50895 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAMP50895 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAMP50895 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAMP50895 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAMP50895 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAMP50895 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAMP50895 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAMP50895 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAMP50895 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAMP50895 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms