Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMUP48645 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMUP48645 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMUP48645 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMUP48645 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMUP48645 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMUP48645 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMUP48645 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMUP48645 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMUP48645 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms