Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC1P48547 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC1P48547 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms