Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL21P46778 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL21P46778 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL21P46778 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL21P46778 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL21P46778 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL21P46778 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL21P46778 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL21P46778 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL21P46778 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL21P46778 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL21P46778 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL21P46778 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL21P46778 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL21P46778 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL21P46778 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL21P46778 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL21P46778 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL21P46778 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL21P46778 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL21P46778 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL21P46778 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL21P46778 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL21P46778 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL21P46778 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL21P46778 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL21P46778 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL21P46778 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL21P46778 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL21P46778 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL21P46778 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL21P46778 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL21P46778 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL21P46778 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL21P46778 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL21P46778 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL21P46778 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL21P46778 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL21P46778 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL21P46778 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL21P46778 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL21P46778 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL21P46778 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL21P46778 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL21P46778 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL21P46778 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL21P46778 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL21P46778 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL21P46778 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms