Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSFP46459 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSFP46459 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSFP46459 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSFP46459 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSFP46459 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSFP46459 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSFP46459 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSFP46459 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSFP46459 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSFP46459 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSFP46459 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSFP46459 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSFP46459 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSFP46459 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSFP46459 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSFP46459 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSFP46459 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSFP46459 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSFP46459 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSFP46459 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSFP46459 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSFP46459 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSFP46459 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSFP46459 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSFP46459 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSFP46459 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSFP46459 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSFP46459 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSFP46459 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSFP46459 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSFP46459 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSFP46459 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSFP46459 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSFP46459 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSFP46459 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSFP46459 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSFP46459 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSFP46459 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSFP46459 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSFP46459 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSFP46459 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSFP46459 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSFP46459 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSFP46459 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSFP46459 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSFP46459 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSFP46459 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSFP46459 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSFP46459 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSFP46459 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSFP46459 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSFP46459 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSFP46459 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSFP46459 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSFP46459 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSFP46459 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSFP46459 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSFP46459 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSFP46459 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSFP46459 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSFP46459 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSFP46459 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSFP46459 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSFP46459 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSFP46459 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSFP46459 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSFP46459 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSFP46459 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NSFP46459 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSFP46459 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSFP46459 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSFP46459 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSFP46459 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSFP46459 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSFP46459 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSFP46459 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms