Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX2-1P43699 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX2-1P43699 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms