Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC26A3P40879 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms