Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP8P40818 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP8P40818 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP8P40818 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP8P40818 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP8P40818 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP8P40818 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP8P40818 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP8P40818 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP8P40818 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP8P40818 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP8P40818 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP8P40818 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP8P40818 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP8P40818 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP8P40818 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP8P40818 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP8P40818 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP8P40818 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP8P40818 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP8P40818 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP8P40818 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP8P40818 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP8P40818 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP8P40818 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP8P40818 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP8P40818 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP8P40818 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP8P40818 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP8P40818 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP8P40818 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP8P40818 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP8P40818 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP8P40818 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP8P40818 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP8P40818 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP8P40818 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP8P40818 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP8P40818 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP8P40818 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP8P40818 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP8P40818 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP8P40818 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP8P40818 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP8P40818 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP8P40818 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP8P40818 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP8P40818 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP8P40818 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP8P40818 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP8P40818 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP8P40818 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP8P40818 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms