Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LTBRP36941 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LTBRP36941 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LTBRP36941 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBRP36941 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBRP36941 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBRP36941 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBRP36941 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBRP36941 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBRP36941 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBRP36941 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBRP36941 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBRP36941 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBRP36941 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBRP36941 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBRP36941 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBRP36941 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBRP36941 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBRP36941 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBRP36941 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBRP36941 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBRP36941 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBRP36941 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBRP36941 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBRP36941 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBRP36941 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBRP36941 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBRP36941 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBRP36941 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBRP36941 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBRP36941 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBRP36941 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBRP36941 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBRP36941 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBRP36941 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBRP36941 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBRP36941 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBRP36941 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBRP36941 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBRP36941 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms