Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER1P34995 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms