Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA9P31269 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms