Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A5P29400 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
COL4A5P29400 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A5P29400 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A5P29400 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A5P29400 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL4A5P29400 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms