Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID4AP29374 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID4AP29374 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID4AP29374 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms