Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBL1P28749 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBL1P28749 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBL1P28749 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBL1P28749 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBL1P28749 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBL1P28749 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBL1P28749 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBL1P28749 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBL1P28749 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBL1P28749 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBL1P28749 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBL1P28749 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBL1P28749 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBL1P28749 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBL1P28749 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBL1P28749 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBL1P28749 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBL1P28749 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBL1P28749 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBL1P28749 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBL1P28749 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBL1P28749 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBL1P28749 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBL1P28749 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBL1P28749 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBL1P28749 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBL1P28749 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBL1P28749 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBL1P28749 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBL1P28749 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBL1P28749 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBL1P28749 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBL1P28749 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBL1P28749 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBL1P28749 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBL1P28749 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBL1P28749 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBL1P28749 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBL1P28749 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RBL1P28749 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBL1P28749 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBL1P28749 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBL1P28749 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBL1P28749 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBL1P28749 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBL1P28749 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBL1P28749 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBL1P28749 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBL1P28749 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBL1P28749 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBL1P28749 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBL1P28749 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBL1P28749 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBL1P28749 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBL1P28749 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBL1P28749 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBL1P28749 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBL1P28749 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms