Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP1P28562 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms