Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRB3P28472 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRB3P28472 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms