Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLD1P28340 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLD1P28340 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLD1P28340 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLD1P28340 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLD1P28340 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLD1P28340 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLD1P28340 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
POLD1P28340 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLD1P28340 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
POLD1P28340 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLD1P28340 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
POLD1P28340 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLD1P28340 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLD1P28340 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLD1P28340 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLD1P28340 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLD1P28340 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLD1P28340 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLD1P28340 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLD1P28340 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLD1P28340 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLD1P28340 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLD1P28340 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLD1P28340 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLD1P28340 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLD1P28340 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
POLD1P28340 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
POLD1P28340 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLD1P28340 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLD1P28340 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POLD1P28340 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLD1P28340 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLD1P28340 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLD1P28340 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLD1P28340 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLD1P28340 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLD1P28340 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLD1P28340 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLD1P28340 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLD1P28340 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLD1P28340 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLD1P28340 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms