Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK4P28324 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK4P28324 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK4P28324 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK4P28324 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELK4P28324 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK4P28324 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK4P28324 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK4P28324 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK4P28324 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK4P28324 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK4P28324 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK4P28324 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK4P28324 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK4P28324 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK4P28324 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK4P28324 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK4P28324 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK4P28324 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK4P28324 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK4P28324 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK4P28324 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELK4P28324 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELK4P28324 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELK4P28324 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELK4P28324 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELK4P28324 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELK4P28324 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELK4P28324 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELK4P28324 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELK4P28324 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELK4P28324 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELK4P28324 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ELK4P28324 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ELK4P28324 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ELK4P28324 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ELK4P28324 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELK4P28324 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms