Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1BP28222 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1BP28222 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms