Protein–RNA interactions for Protein: P27540

ARNT, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTP27540 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARNTP27540 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARNTP27540 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARNTP27540 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARNTP27540 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARNTP27540 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARNTP27540 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARNTP27540 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARNTP27540 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARNTP27540 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARNTP27540 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARNTP27540 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARNTP27540 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARNTP27540 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARNTP27540 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARNTP27540 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARNTP27540 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARNTP27540 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARNTP27540 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARNTP27540 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARNTP27540 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARNTP27540 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARNTP27540 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARNTP27540 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARNTP27540 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARNTP27540 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARNTP27540 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARNTP27540 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARNTP27540 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARNTP27540 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARNTP27540 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARNTP27540 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARNTP27540 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARNTP27540 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARNTP27540 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARNTP27540 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARNTP27540 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARNTP27540 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARNTP27540 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARNTP27540 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARNTP27540 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARNTP27540 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARNTP27540 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARNTP27540 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms