Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTFP26441 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTFP26441 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTFP26441 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTFP26441 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTFP26441 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTFP26441 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTFP26441 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTFP26441 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTFP26441 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTFP26441 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTFP26441 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTFP26441 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTFP26441 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTFP26441 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTFP26441 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTFP26441 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTFP26441 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTFP26441 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTFP26441 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTFP26441 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTFP26441 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTFP26441 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTFP26441 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTFP26441 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTFP26441 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTFP26441 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTFP26441 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTFP26441 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTFP26441 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTFP26441 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTFP26441 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTFP26441 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTFP26441 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTFP26441 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTFP26441 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTFP26441 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTFP26441 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTFP26441 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTFP26441 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTFP26441 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTFP26441 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTFP26441 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTFP26441 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTFP26441 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTFP26441 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTFP26441 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTFP26441 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms