Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IVDP26440 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IVDP26440 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IVDP26440 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IVDP26440 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IVDP26440 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IVDP26440 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IVDP26440 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IVDP26440 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IVDP26440 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IVDP26440 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IVDP26440 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IVDP26440 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IVDP26440 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IVDP26440 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IVDP26440 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IVDP26440 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IVDP26440 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IVDP26440 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IVDP26440 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IVDP26440 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IVDP26440 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IVDP26440 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IVDP26440 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IVDP26440 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IVDP26440 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IVDP26440 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IVDP26440 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IVDP26440 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IVDP26440 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IVDP26440 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IVDP26440 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IVDP26440 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IVDP26440 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IVDP26440 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IVDP26440 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IVDP26440 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IVDP26440 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IVDP26440 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IVDP26440 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IVDP26440 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IVDP26440 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IVDP26440 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IVDP26440 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IVDP26440 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IVDP26440 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IVDP26440 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IVDP26440 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms