Protein–RNA interactions for Protein: P25364

HCM1, Forkhead transcription factor HCM1, yeastyeast

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCM1P25364 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt5.57□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YLR225CYLR225C 1224 nt5.57□□□□□ -1.52
HCM1P25364 SET6YPL165C 1122 nt5.57□□□□□ -1.52
HCM1P25364 RPL21AYBR191W 483 nt5.57□□□□□ -1.52
HCM1P25364 STE13YOR219C 2796 nt5.57□□□□□ -1.52
HCM1P25364 TRP5YGL026C 2124 nt5.57□□□□□ -1.52
HCM1P25364 PDR18YNR070W 4002 nt5.57□□□□□ -1.52
HCM1P25364 NSA1YGL111W 1392 nt5.56□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YFR006WYFR006W 1608 nt5.56□□□□□ -1.52
HCM1P25364 USB1YLR132C 873 nt5.56□□□□□ -1.52
HCM1P25364 MTF1YMR228W 1026 nt5.56□□□□□ -1.52
HCM1P25364 BUD21YOR078W 645 nt5.56□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YBR013CYBR013C 390 nt5.56□□□□□ -1.52
HCM1P25364 CLN2YPL256C 1638 nt5.56□□□□□ -1.52
HCM1P25364 HIR1YBL008W 2523 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 MMP1YLL061W 1752 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 TFC7YOR110W 1308 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 snR63snR63 255 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 SPC34YKR037C 888 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 GEP5YLR091W 882 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 PIN2YOR104W 849 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YBR016WYBR016W 387 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 CPA1YOR303W 1236 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 TAF3YPL011C 1062 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YPR142CYPR142C 564 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 GUD1YDL238C 1470 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 CLB1YGR108W 1416 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 CRZ1YNL027W 2037 nt5.55□□□□□ -1.52
HCM1P25364 VPS36YLR417W 1701 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 FAA4YMR246W 2085 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 RPC25YKL144C 639 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YLR156WYLR156W 345 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YLR159WYLR159W 345 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YLR161WYLR161W 345 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 SPC2YML055W 537 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 RRT1YBL048W 312 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 RPC19YNL113W 429 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 ROX3YBL093C 663 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 ATP20YPR020W 348 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 MAK11YKL021C 1407 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 BPL1YDL141W 2073 nt5.54□□□□□ -1.52
HCM1P25364 ALD6YPL061W 1503 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 TFC6YDR362C 2019 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 RPN6YDL097C 1305 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 SRO9YCL037C 1305 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 APE3YBR286W 1614 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 VPS70YJR126C 2436 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 CAD1YDR423C 1230 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 JAC1YGL018C 555 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YGR273CYGR273C 525 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 RHO4YKR055W 876 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 ATG33YLR356W 594 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 REH1YLR387C 1299 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YLR456WYLR456W 615 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 SRT1YMR101C 1032 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 INP1YMR204C 1263 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.53□□□□□ -1.52
HCM1P25364 PTC1YDL006W 846 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 COX26YDR119W-A 201 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 ACT1YFL039C 1128 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 SPO74YGL170C 1242 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 CUP1-1YHR053C 186 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 CUP1-2YHR055C 186 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 CMC1YKL137W 336 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 RUF22RUF22 515 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 snR19snR19 568 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 CNS1YBR155W 1158 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 MCM6YGL201C 3054 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 ALG1YBR110W 1350 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 KKQ8YKL168C 2175 nt5.52□□□□□ -1.53
HCM1P25364 PFA5YDR459C 1125 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 FIP1YJR093C 984 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 DID4YKL002W 699 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 SMD3YLR147C 306 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 PRE7YBL041W 726 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 PGA2YNL149C 390 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 BBP1YPL255W 1158 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 HST1YOL068C 1512 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 CEG1YGL130W 1380 nt5.51□□□□□ -1.53
HCM1P25364 SCT1YBL011W 2280 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 MNN5YJL186W 1761 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 COG2YGR120C 789 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 DJP1YIR004W 1299 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 CMS1YLR003C 876 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 STE50YCL032W 1041 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 SFB3YHR098C 2790 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 GFA1YKL104C 2154 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 GEX1YCL073C 1848 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 GEX2YKR106W 1848 nt5.5□□□□□ -1.53
HCM1P25364 PRP19YLL036C 1512 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YDL162CYDL162C 357 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 AIM6YDL237W 1173 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YDR109CYDR109C 2148 nt5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms