Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNE1P24864 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms