Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAX3P23760 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAX3P23760 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAX3P23760 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAX3P23760 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAX3P23760 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX3P23760 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX3P23760 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX3P23760 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX3P23760 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX3P23760 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX3P23760 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX3P23760 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX3P23760 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX3P23760 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX3P23760 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX3P23760 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX3P23760 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX3P23760 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX3P23760 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX3P23760 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX3P23760 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX3P23760 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX3P23760 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX3P23760 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX3P23760 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX3P23760 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX3P23760 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX3P23760 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX3P23760 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX3P23760 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX3P23760 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX3P23760 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX3P23760 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX3P23760 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX3P23760 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX3P23760 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX3P23760 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX3P23760 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX3P23760 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX3P23760 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX3P23760 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX3P23760 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX3P23760 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX3P23760 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX3P23760 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX3P23760 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX3P23760 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX3P23760 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX3P23760 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX3P23760 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX3P23760 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAX3P23760 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms