Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ITGA6P23229 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA6P23229 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms