Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EPHA1P21709 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPHA1P21709 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms